最近几天,ai for science领军企业神石科技首次公布了其ridymo # 8482管道应用的发展管道进度的披露充分验证了神石科技的ridymo # 8482该平台在实际药物开发中的巨大潜力,也是ai for science从算法到工具再到应用的新范式更充分的例证
神石科技首席医药官张小敏博士表示,神石科技基于ai为科学创造的ridymo # 8482平台,通过动态模拟探索蛋白质在体内的构象变化,找到一个全新的药用口袋基于此,开发的非共价分子在酶和细胞水平上的抑制活性与正共价分子相当,并且具有更好的药用性能这种做法让我们充分验证了ridymo # 8482该平台在药物研发方面的价值有望赋能更多未来难以成为药物靶点的药物发现
ridymo # 8482该平台是基于强化动力学算法开发的动态平台,重点解决难制药目标对比其他动态算法和平台,ridymo # 8482核心优势在于模拟采样效率的巨大提升同时,充分结合神经网络的高维表示能力,可以高效捕捉复杂生物大分子系统中的动态构象变化,在计算资源和模拟时长相对可控的情况下,蛋白质可以真正动起来
此前,rid算法作为平台的核心能力,已经发表在《自然》杂志上本文研究表明,对于一个蛋白质的从头算折叠问题,rid模拟在1.86 μs时间内得到的自由能曲面比传统分子动力学方法在100 μs内得到的自由能曲面更全面,说明rid方法的分子模拟效率提高了近100倍
基于rid方法,ridymo # 8482增强型动态平台可用于解决以下问题:
#8226,对于平面或蛋白质—蛋白质相互作用系统,ridymo # 8482可用于诱导药囊的形成和探索不同结构的新药囊。
#8226,ridymo#8482针对gpcr,通道蛋白等结构动态变化较大的系统,它可以分析运动轨迹中残留的相关性,有助于药物靶标作用机制的研究和药物筛选。
#8226,ridymo#8482,一种在体内缺乏稳定结构的无序蛋白质,有可能探索蛋白质在热力学和动力学中的重要构象,发现药物结构。
#8226,另外,药物最终需要在体内生效,仅考虑结合强度这一热力学参数是不够的,ridymo # 8482它可以有效地计算与药物在体内的强药效相关的动力学参数,如药物的停留时间,这在过去常常被忽略。
ridymo # 8482该平台致力于建立药物分子发现中的构效关系,通过将sar和spr紧密结合,可以高效促进高质量临床前候选化合物的发现。
神石科技药物r&d团队基于ai for science新范式,依托神石科技全球领先的密集动力学平台ridymo#8482,专注于利用人工智能与分子模拟相结合的先进计算手段,驱动难造药物靶点的药物研发,和高分子从头设计平台目前已经通过自建管道 联合开发形成了完整的r&d体系,覆盖中枢神经系统,肿瘤,自身免疫性疾病三大领域未来,神石科技将一如既往地践行科学研究的ai新范式,为人类文明最基础的科学探索,成果应用,造福全人类做出自己的贡献
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